Variabilidade genética de búfalos em rebanho-núcleo com base na análise de pedigree / Genetic variability in water buffalo from nucleous herd by pedigree analysis

Parâmetros baseados na probabilidade de origem do gene foram usados para descrever a variabilidade em uma população de búfalos da Embrapa Amazônia Oriental. A magnitude dos resultados foi de média a baixa (por volta de 20 animais), sugerindo que poucos fundadores contribuiriam para a formação da população. Dentre os 20 ancestrais que mais aportam genes aos machos - representando ao todo 71 por cento dos alelos -, 39 por cento, 26 por cento e 5 por cento, respectivamente, são as contribuições marginais das raças Murrah e Mediterrâneo e seus mestiços. Para as fêmeas, em que os 20 ancestrais aportam 67,5 por cento dos genes, 42 por cento e 26 por cento, respectivamente, são as contribuições marginais das raças Murrah e Mediterrâneo.

Parameters based on the probability of gene origin were used to describe genetic variability in a buffalo population from the Embrapa Amazônia Oriental, Belém, Pará, Brazil. The parameters generated medium to low values (around 20 animals) and suggested low founder representativeness. From the 20 ancestors that gave more genes to males (with 71 percent of alleles), genetic contributions were 39 percent, 26 percent, and 5 percent, respectively, for Murrah, Mediterraneo, and crossbreds. For females, these values were 42 percent and 26 percent for Murrah and Mediterraneo breeds.

Contribuição dos efeitos de genearcas e de famílias sobre a probabilidade de permanência em rebanhos da raça Nelore / Breeders and family effects in stayability in Nellore herds

Foram preditas diferenças esperadas na progênie para probabilidade de permanência no rebanho (stayability) de 4180 touros com filhas na base de dados do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore, utilizando-se modelo de limiar unicaráter de touro-avô materno, sob metodologia bayesiana. Os touros foram classificados em ordem decrescente e aqueles com diferenças esperadas na progênie acima de 57,6 por cento, considerados como TOP1 por cento, foram analisados quanto à genealogia visando avaliar a existência de efeito de família, bem como a contribuição dos genearcas e ancestrais da raça Nelore para a característica considerada. Os principais fundadores, que juntos somaram 18,8 por cento dos genes presentes nos touros TOP1 por cento, foram Karvadi IMP (com 8,2 por cento dos genes, essencialmente via seu filho Chummak), Godhavari IMP (com 6 por cento de contribuição, via Kurupathy e Neófito), Rastã IMP e Falo da BV (2,5 e 2,1 por cento, respectivamente, via materna, pois não apresentaram parentesco com touros ancestrais). O touro Rolex, da variedade mocha, esteve presente em 12 linhas (maternas ou paternas), via seu neto Cardeal. Dos sete ancestrais da raça Nelore com maiores contribuições genéticas (que somaram 15,3 por cento dos genes), cinco foram da variedade mocha. Somente 28 animais aportaram 50 por cento da variabilidade genética, evidenciando o baixo número de animais utilizados como reprodutores na raça Nelore

Expected progeny differences (EPD) for stayability were estimated for 4,180 sires with daughters in the Program for Genetic Improvement of the Nellore Breed. The univariate threshold sire-maternal grandsire model was used, following a Bayesian methodology. The sires were ranked for stayability in descending order, and those whose EPD were higher than 57.6 percent were regarded as TOP1 percent. Pedigree analysis was then conducted in order to establish whether a family tendency was present, as well as the contribution of Nellore founders and ancestors for the trait under consideration. The main founders, which together were responsible for 18.8 percent of the genes in TOP1 percent sires, were Karvadi IMP (with 8.2 percent of genes, basically through its son Chummak), Godhavari IMP (with 6 percent of genes, through Kurupathy and Neofito), Rastã IMP and Falo da BV (respectively with 2.5 percent and 2.1 percent, through mothers, since they are not related to the ancestor sires). Rolex, a polled sire, stayed in twelve lineages - paternal or maternal - through its grandson Cardeal. Among the seven Nellore ancestors with the highest genetic contributions (15.3 percent of genes when put together), five were of the polled variety. Only 28 animals apportioned 50 percent of the total genetic variability, which is indicative of the small number of animals used as Nellore reproducers

Pedigree analyses in the Breeding Program for Nellore Cattle

Parameters based on the probability of gene origin were used to describe genetic variability in three reproductive groups from the Breeding Program for Nellore Cattle (PMGRN). The three reproductive populations (cows in reproductive age, bulls from artificial insemination centers and young bulls in progeny test) generated medium to low values. The effective number of founders (Nf ), the effective number of ancestors (Na) and the remaining genomes (Ng) suggest low founder representativeness, high genetic contribution by some ancestors, considerable loss of founder alleles and lack of allelic representativeness in bulls kept in artificial insemination centers and young sires in progeny test in relation to the diversity on the farms participating in the PMGRN. The parameters based on the probability of gene origin in the three reproductive groups were: 84.3, 53 and 54.2 (Nf ); 71, 36.6 and 30 (Na) and 51.4, 19.3 and 19 (Ng) for cows, bulls from artificial insemination centers and young sires in progeny test, respectively. Future matings and the introduction of selected progeny reproduction may decrease the parameters based on the probability of gene origin in each reproductive group, thereby increasing considerably the additive relationship in the three reproductive groups and consequently increasing the probability of inbreeding in the future. Strategies to maintain genetic variability in bull populations must be implemented.